Kunnen we genomische informatie gebruiken om inteelt te beheersen?

Omdat fokkers streven naar maximale genetische vooruitgang, staan ze vaak voor een dilemma tussen het behalen van genetische winst of het beheersen van inteelt; om duurzame fokkerij aan te moedigen, moeten we een methode vinden die een goede balans biedt tussen beide. Kijken naar genomische informatie om inteelt te beheersen, kan voor u als varkenshouder bijdragen aan meer vooruitgang in de fokkerij op lange termijn, terwijl ook de schadelijke effecten van inteelt worden verminderd.

De R&D-afdeling van DanBred onderzoekt nu nieuwe methoden voor het beheersen van inteelt met behulp van genomische informatie. Door de methode om inteelt te beheersen te optimaliseren, streven we ernaar om in de toekomst nog effectievere en duurzamere DanBred-varkens aan te bieden. In een huidig promotieonderzoek – dat een samenwerking is tussen Fokkerij & Genetica bij de Deense Agricultuur & Voedsel Raad, Varken, en de Universiteit van Aarhus – wil Cathrine Borgsted Bak laten zien hoe genomische informatie kan worden gebruikt om inteelt te beheersen door te kijken naar de verschillende regio’s van het genoom onder alle fokkandidaten. Het gebruik van genomische informatie om inteelt te beheersen, kan bijdragen aan gezondere varkenspopulaties met meer genetische winst en het behoud van genetische variatie, wat nodig is om ervoor te zorgen dat u ook in de toekomst de meest robuuste varkens krijgt.

Cathrine Borgsted Bak legt uit: “Door deze nieuwe methode te gebruiken, kunnen we een hogere mate van inteelt accepteren in de gebieden die de meeste genetische vooruitgang genereren voor de eigenschappen in het fokdoel, terwijl we inteelt zo veel mogelijk kunnen vermijden in de gebieden die geen genetische vooruitgang genereren. Op deze manier kunnen we de mogelijke schadelijke effecten van inteelt nog meer verminderen en meer genetische vooruitgang op de lange termijn creëren voor alle eigenschappen in het DanBred-fokdoel, waar de varkenshouders baat van hebben.”

Hoe genomische informatie kan worden ingezet

De verwachting is dat de nieuwe methode die in het promotieonderzoek wordt gebruikt, kan worden geïmplementeerd in het DanBred-fokprogramma via EVA, een programma dat specifiek is ontworpen om inteelt te beheersen. Momenteel wijst EVA inseminaties toe op basis van stamboominformatie, terwijl deze nieuwe methode gebruik zal maken van genomische informatie.

“Tot nu toe is er geen optimale manier gevonden om genomische informatie te gebruiken om inteelt te beheersen en de genetische vooruitgang te vergroten. Daarom zullen de vier werkpakketten zo worden gestructureerd dat ze een nauwkeurige schatting, monitoring en controle van inteelt in segmenten langs het genoom onthullen”, zegt Cathrine Borgsted Bak.

Selectiekenmerken

Kenmerken voor selectie is een brede definitie voor kenmerken die aangeven dat selectie heeft plaatsgevonden in bepaalde delen van het genoom. Genotypen veranderen in de loop van de tijd, en geleidelijk zal selectie resulteren in verlies van genetische variatie in bepaalde delen van het genoom. In sommige gevallen zullen er duidelijke tekenen van selectie zijn in de chromosomen van het individu die grotere kenmerken in het genoom hebben getoond dan andere. Deze kenmerken weerspiegelen de delen die de voorkeur genieten in de geselecteerde eigenschappen. Dit kan echter ook een teken zijn van een ongunstige toename van de mate van inteelt. Door inteelt aan te pakken op basis van genomische informatie, is het mogelijk rekening te houden met regionale toenames van inteelt langs het genoom.